竹のさんのgnuplot に関する情報やメモ(03/03 2011）
を読みました。

MSVCにおけるビルドでは非常に参考になると思います。

その中でいくつか気になる点がありました。

１．一部のソースには VC++ には通らない (C99 的な) 書き方が使われているので、
まずそこを修正する必要があります。

であれば，ローカルにそのパッチを持つのではなく，本家に送って
#ifdefかなにかでMSVCでは，
C99的なソースを使わないようなコードを本体に埋め込むようにするほうが
いいような気がします。

２．pgnuplot は、gnuplot-4.4 から config/makefile.nt がだいぶ書き換えられて、
console 版の gnuplot をコンパイルするようになっているのですが、
/subsystem:windows がついているためにリンクがうまくいきません。

これはVersion 4.4のgnuplotのあり方とは違います。
console 版の gnuplotはgnuplot.exeであり，pgnuplot.exeではありません。
どちらかというとversion 4.3の古いパッチから書き直っていないと
思います。
pgnuplotはあくまで以前と同じw32apiを使ってwgnuplotにパイプを流す
だけのものです。

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makefile.ntがメンテされていないのだと思います。
２の点は修正すべきものでパッチを送られたほうがよいのではと思います。

〔ツリー構成〕

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