松田さんと同じく、そもそも 1000 個ものグラフを同時に書くのは意味があるん
だろうか、とは思いますので、そちらが意図したものにはならないだろうという
気はしますが、一応最初の回答を書きます。

ところで、awk が何だとは書いてありませんでしたが、Vine だと多分 GNU awk 
でしょうね。GNU awk なら大丈夫です。

BEGIN{
  print "plot \"test.dat\" using 1:2, \\";
  for(j=3;j<1000;j++) printf "\"\" using 1:%d, \\\n",j;
  print "\"\" using 1:1000\n";
}

程度で OK だと思います。

〔ツリー構成〕

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┣【1554】 re(5):複数列のプロット 2007/3/31(土)21:37 竹の (464)

┣【1555】 re(6):複数列のプロット 2007/4/2(月)10:16 内藤 (671)