もう一つ、yrange の reverse option を使うという手もあります。
特に、autoscale で使用したい場合は、reverse を使って

set yrange [*:*] reverse

とする必要があります。ちなみに、

set yrange [1:0]
set yrange [1:0] reverse
set yrange [0:1] reverse

は、いずれも同じですね。

〔ツリー構成〕

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