ありがとうございます。

説明不足ですみません。
gnuplot_binaryは絶対パスで指定しています。

gnuplot_binary = /cygdrive/c/PROGRA~1/GNUPLO~1/gnuplot/pgnuplot.exe

t=linspace(0,2*pi,100);
y=sin(t);
data=[t' y'];
gplot data
では，pgnuplotが起動します。
Cygwin-Xを起動してない状態でplot(t, y)としようとすると

******************************
octave:3> plot (t,y);
Can't open display
Failed initializing GUI, exiting
grplot: problem writing to pipe !
warning: in fopen near line 23, column 13:
warning: fopen: default open mode is now binary
Can't open display
Failed initializing GUI, exiting
grplot: problem writing to pipe !
octave:4> Can't open display
Failed initializing GUI, exiting
******************************

とでます。
Cygwin-Xを起動しているとGraceが立ち上がりプロットします。

ビルドしたときのconfig.logをみると
configureではpgnuplotの存在を確認しているようです。
Cygwin-Xが存在する環境でビルドしているのでGraceを使うように
ビルドされてしまったのかもしれません。
grepでgraceというキーワードでビルドしたディレクトリあたりを
検索かけたのですがよくわかりませんでした。
MATLABと共存させているわけでもないので
gplotでかけばいいといえばいいのですが。

〔ツリー構成〕

【855】 Octave + Cygwinのplotでpgnuplotを起動するには 2005/5/11(水)16:44 松岡 (409) ≪

┣【856】 re(1):Octave + Cygwinのplotでpgnuplotを起動するには 2005/5/11(水)22:18 松岡 (155)

┣【857】 re(2):Octave + Cygwinのplotでpgnuplotを起動するには 2005/5/12(木)02:04 松田七美男 (115)

┣【858】 re(3):Octave + Cygwinのplotでpgnuplotを起動するには 2005/5/12(木)10:23 松岡 (1153)

┣【859】 re(4):Octave + Cygwinのplotでpgnuplotを起動するには 2005/5/12(木)13:09 松岡 (295)