2005-08-04以降のCVS版（V4.1）からwgnuplot.iniが保存されるフォルダーがwindowsのインストールフォルダから
各ユーザーのapplication dataフォルダに変更されたようです。
ファイルの読み書きの権限の問題を解消するためです。
拙ホームページにこの変更に伴う応用バッチファイルの書き換えたものを掲載しました。
http://www.nuce.nagoya-u.ac.jp/e8/Matsuoka/gnuplot_memo.html

〔ツリー構成〕

【997】 wgnuplot.iniの保存フォルダーの変更 2005/9/8(木)13:06 松岡 (354) ≪

┣【1006】 re(1):wgnuplot.iniの保存フォルダーの変更 2005/9/16(金)10:38 taiyo (561)

┣【1011】 re(2):wgnuplot.iniの保存フォルダーの変更 2005/9/16(金)20:46 松岡 (231)

┣【1017】 re(3):wgnuplot.iniの保存フォルダーの変更 2005/9/20(火)09:22 taiyo (223)

┣【1021】 re(4):wgnuplot.iniの保存フォルダーの変更 2005/9/20(火)18:24 松岡 (661)

┣【1023】 re(5):wgnuplot.iniの保存フォルダーの変更 2005/9/21(水)09:09 taiyo (269)