「スペクトログラム」というのはその筋の専門用語だろうと思いますので、
具体的にデータの形式がどのようなもので、それに対してどのような形式の
表示を望んでおられるのかを、もう少し詳しく説明されると回答が来るだろ
うと思います。

サンプルのグラフがどこかにあるならその URL 等を参照するとさらにいい
でしょう。

gnuplot-4.2.6 なら pm3d が使えますし、色の出力はだいぶできるように
なっています。よって、例えば

http://w3voice.jp/specgram/

のようなグラフがお望みなら、データ形式によっては gnuplot の set pm3d
map で十分表現できそうな気がします。

# 「gnuplot の精義」には set pm3d map の話は少ししか書いてないみたい

〔ツリー構成〕

【2147】 スペクトログラムの表示 2009/11/23(月)12:59 agt (346) ≪

┣【2148】 re(1):スペクトログラムの表示 2009/11/23(月)14:48 竹の (605)

┣【2149】 re(2):スペクトログラムの表示 2009/11/23(月)15:42 agt (678)

┣【2150】 re(3):スペクトログラムの表示 2009/11/24(火)14:39 竹の (215)

┣【2151】 re(4):スペクトログラムの表示 2009/11/26(木)13:29 agt (1974)

┣【2152】 re(5):スペクトログラムの表示 2009/11/26(木)17:48 竹の (203)

┣【2153】 re(6):スペクトログラムの表示 2009/11/26(木)19:21 agt (206)

┣【2154】 re(7):スペクトログラムの表示 2009/11/26(木)19:41 竹の (371)

┣【2155】 re(8):スペクトログラムの表示 2009/11/26(木)23:38 松田七美男 (784)

┣【2156】 re(9):スペクトログラムの表示 2009/11/27(金)08:47 竹の (386)

┣【2157】 re(8):スペクトログラムの表示 2009/11/27(金)13:26 竹の (1364)

┣【2158】 re(9):スペクトログラムの表示 2009/11/27(金)15:15 松田七美男 (151)

┣【2162】 re(9):スペクトログラムの表示 2009/11/30(月)15:30 agt (2537)