しつこくてすみません。

valley> 竹の> set ytics scale 0.001
valley> コレでやってみましたが、やはり肝心なセル間(とでも言うべきか?)の線も一緒に消えてしまいます。

うちでは問題なく出る (gnuplot-5.0.0, 5.0.1, CVS 版いずれも) ので、なん
でかなと試してみましたが、これは指定順序によるようです。すなわち、上の
set ytics scale 0.001 を、

set ytics add 0,1,DATA_H
set mytics 2
set grid noytics mytics front linetype -1

の後に指定すると、おっしゃる通り横線が消えてしまいますが、set ytics
scale 0.001 をこれらの前に指定すればうまくいきます。

この順序依存性自体は、少し怪しい (バグ ?) 気もしますので、時間がある時
に少し調べてみたいと思います。
なお、

valley> arrowでできるので、そちらで対応することします。

ということですので、返信は結構です。

〔ツリー構成〕

【3027】 2D headmapで各マスへ枠線描画 2015/10/16(金)19:12 valley (1055) ≪

┣【3028】 re(1):2D headmapで各マスへ枠線描画 2015/10/16(金)19:43 valley (111)

┣【3029】 re(1):2D headmapで各マスへ枠線描画 2015/10/16(金)22:56 竹の (704)

┣【3030】 re(2):2D headmapで各マスへ枠線描画 2015/10/20(火)01:03 valley (171)

┣【3032】 re(2):2D headmapで各マスへ枠線描画 2015/10/21(水)17:53 竹の (975)

┣【3039】 re(3):2D headmapで各マスへ枠線描画 2015/11/5(木)18:15 valley (1816)

┣【3040】 re(4):2D headmapで各マスへ枠線描画 2015/11/5(木)20:50 竹の (213)

┣【3041】 re(5):2D headmapで各マスへ枠線描画 2015/11/6(金)07:43 valley (256)

┣【3042】 re(6):2D headmapで各マスへ枠線描画 2015/11/6(金)10:50 竹の (255)

┣【3043】 re(7):2D headmapで各マスへ枠線描画 2015/11/11(水)00:57 valley (375)

┣【3045】 re(8):2D headmapで各マスへ枠線描画 2015/11/11(水)10:15 竹の (738)

┣【3046】 re(9):2D headmapで各マスへ枠線描画 2015/11/11(水)12:31 竹の (873)

┣【3047】 re(9):2D headmapで各マスへ枠線描画 2015/11/11(水)19:49 valley (564)