OS がわかりませんが、Unix の場合はそういう場合、普通 paste とか join とかを
使うんだと思います。

1290 では awk と書きましたが、awk でもできないことはないですが、ちょっと面倒
です。awk だとこんな感じでしょうか (GNU awk でないとだめかも)。

awk -v f1=file1 '(FILENAME==f1){h[NR]=$0; next}{print h[NR],$0}' file1 file2
> file3

〔ツリー構成〕

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