残念ながら、gnuplot では %S の秒数は、標準では整数しか扱えません
(src/time.c)。だから、無理矢理それをしたければ、後は標準でない裏
技みたいな手しかないと思いますが、ちなみに、これは x 軸のメモリ
の見出しはどのようにしたいのでしょうか。

たとえば、1 秒以下の違いを見る、というなら、「2007 年 4 月 4 日」
とか書くのは無駄ですし、時間部分も変化するような範囲で見るなら 1
秒以下は誤差の範囲ですよね。

だから、1 秒以下の違いを見る、ということは xrange だって 1 分以内
とかのかなり狭い範囲で、秒より上の数字は意味がないじゃないでしょ
うか。そうだとしたら上の桁は無視して秒のデータだけ取り出して見る
(help plot datafile using 参照) というのではだめなんでしょうか。

〔ツリー構成〕

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