gnuplot は部分的なデータの選択も可能です (every)。

しかし、提示された例は、x 座標を 3 つ選んで、y 座標を 4 つ選ぶ (?)
ような例になっていて、何がやりたいのかよくわかりませんので、どうし
たいのかをもう少し詳しく書いて頂ければ回答できるかもしれません。

〔ツリー構成〕

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