windows のapiを使ってコマンドを流し込む方法があります。
windows版のpgnuplotはpipeを実現するためにpipeとapiの方法をつなぐ
プログラムです。
cvsのリポジトリなどからpgnuplotのソースを手に入れて
ソースを参考にプログラムされるとよいと思います。

〔ツリー構成〕

【1417】 gnuplotを他のプログラムからパイプ以外で使うには 2006/10/29(日)00:33 yu (386) ≪

┣【1420】 re(1):gnuplotを他のプログラムからパイプ以外で使うには 2006/10/31(火)06:16 松岡 (238)

┣【1422】 re(2):wgnuplotとpgnuplot 2006/11/2(木)00:41 yu (1007)

┣【1424】 re(3):wgnuplotとpgnuplot 2006/11/2(木)08:52 竹の (257)

┣【1511】 re(4):wgnuplotとpgnuplot 2007/3/4(日)21:03 竹の (306)