竹の> データの行数がわからなければ、2 回 stats を使えばいいでしょう。
竹の> 
竹の> stats 'data' noout
竹の> array col2[STATS_records]
竹の> i = 0
竹の> stats 'data' using (i=i+1, col2[i]=$2) noout

この例をfeature request
https://sourceforge.net/p/gnuplot/feature-requests/436/

にあげたところ，array.demに次のようなサンプルがつきました。

http://gnuplot.cvs.sourceforge.net/viewvc/gnuplot/gnuplot/demo/array.dem?r1=1.1&r2=1.2

ありがとうございました。

〔ツリー構成〕

【3082】 配列変数のサポート 2016/2/10(水)21:05 竹の (779) ≪

┣【3083】 re(1):配列変数のサポート 2016/2/11(木)11:28 松岡 (270)

┣【3085】 re(2):配列変数のサポート 2016/2/12(金)12:39 竹の (865)

┣【3086】 re(3):配列変数のサポート 2016/2/12(金)15:38 松岡 (273)

┣【3087】 re(4):配列変数のサポート 2016/2/13(土)08:01 松岡 (229)

┣【3090】 re(2):配列変数のサポート 2016/2/18(木)18:54 竹の (710)

┣【3091】 re(3):配列変数のサポート 2016/2/18(木)19:32 松岡 (270)

┣【3092】 re(3):配列変数のサポート 2016/2/19(金)08:22 松岡 (318)

┣【3093】 re(4):配列変数のサポート 2016/2/19(金)13:18 竹の (512)

┣【3094】 re(5):配列変数のサポート 2016/2/20(土)13:28 松岡 (199)

┣【3098】 re(3):配列変数のサポート 2016/3/3(木)13:08 松岡 (452)

┣【3099】 re(4):配列変数のサポート 2016/3/4(金)10:44 竹の (681)